所谓办公自动化，主要是指利用现代化的办公设备、计算机技术和通信技术来代替办公人员的手工作业，从而大幅度地提高办公效率。办公自动化设备早在八十年代就已经开始在我国得到普及应用，而电子政务系统的大规模应用基本上是九十年代中期以后的事情，所以我们不难发现两者之间的差异。

具体地说，电子政务和办公自动化系统在以下方面存在明显的差异：1，其应用定位不同。电子政务侧重于政府部门内部以及跨部门、系统和地区的应用，而办公自动化系统的应用重点一般是在部门内部，并且集中于办公人员的个人层面。2，二者的应用主体不同。办公自动化广泛地应用于几乎所有的党政机关和企事业单位，而电子政务顾名思义，其应用主体主要是各级政府部门。3，在系统用户方面，电子政务与办公自动化系统也存在一定的差别。具体地说，办公自动化系统的用户多为办公人员，而电子政务由于一般是互动式进行，所以其系统用户的范围要广得多，除了政府部门的工作人员之外，还包括与这些部门相关的企业和公众等。

虽然电子政务和办公自动化在应用定位、应用主体、功能、系统管理模式等方面均存在较大的差异，但是它们之间仍然有着十分密切的关系。由于电子政务实现了打破部门界线的联网办公和互动式作业，所以我们可以把电子政务看作是办公自动化系统在范围和功能上的对外延伸，是面向全社会的政府办公自动化。