一些常用方法，在电算化系统下还是适用的，比如审阅、核对、监盘、询证、现场观察、分析性复核等。特别是对于实物的监督盘点、向有关单位或部门询证、到工作现场观察，在两种系统条件下具有同等的重要性，审计人员都应予以充分的关注。但由于电算化系统下的数据处理方式有很大的不同，因此在实质性测试中就要求使用一些特有的方法和技术。
（二）不同点
1.更需要借助计算机进行审计。一般来说，不管对手工系统还是对电算化系统，审计都可以利用计算机辅助审计工作。但对电算化系统审计时，这种要求更为迫切，因为电算化系统下，除了原始凭证外，其他数据文件都以机器可读的形式存储在有关磁性介质中。虽然有些企业要求定期打印有关凭证、账簿、报表，但审计人员并不能确定打印的资料和机读数据完全一致，因此出于职业谨慎性的考虑，审计人员仅对打印资料进行审查是不够的，还应当对机读数据文件进行审查。而我国目前不少审计人员仍采用绕过计算机审计的办法。
2.有些核对程序的意义下降。电算化系统下，主数据库文件是凭证库，明细账、总账、报表文件都由其生成，明细账、总账、报表之间的制约关系已不复存在，因此它们之间的核对工作已不如手工系统下那样能提供有力的证据，因此核对程序的意义下降。并且在计算机辅助审计的情况下，核对工作可由计算机自动完成，这样审计人员就可以从大量的重复性劳动中解脱出来，关注一些更有意义的事项，从而提高审计效率。但是原始凭证与记账凭证之间的核对仍是至关重要的。
3.分析性复核程序显得更为重要。通过前面的分析，我们知道，在电算化系统下，如果程序发生错误或被故意篡改，仅通过常用的审阅。核对的方法是很难发现的，而通过分析性复核程序可以验证客户的资料是否符合客观规律。这就要求审计人员提高对有关客观规律的认识能力，要求其视野开阔，不仅要了解微观方面的信息，还要了解宏观方面的信息，如行业、部门及整个国民经济方面的信息；不仅要了解经济管理方面的信息，还要了解技术方面的信息。只有这样，才能有效地利用分析性复核程序获取有力的证据。

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