对农民合作经济组织加以指导、扶持和规范。
(二)农民合作经济组织登记管理存在诸多问题
主要有以下几个问题：1.大部分农民合作经济组织没有申请登记。总体来说，这两个省的农民合作经济组织处于比较松散的状态，绝大部分是自行成立的，没有获得法律上的认可。如贵阳市，250个专业协会中，已向有关部门申请登记注册或备案的有 47个，正在办理的1个，其余202个专业协会都没有经过登记注册或备案。2.登记不规范、管理混乱。两省负责农民合作经济组织登记管理的部门有农业、科技、民政和工商等部门。如贵州1079个农民合作经济组织中，已申请登记的有434个，其中，向工商部门登记的有84个，向民政部门登记的有62个，向农业部门登记的有222个，在科技等其他部门登记的有66个。3.登记手续繁杂、费用较高。按照贵州省关于农民合作经济组织试点实施意见的规定，县级、乡级、村级合作经济组织的注册资金分别为5000元、3000元和1000元。除了注册资金，农民合作经济组织还要缴纳公告费、代码证*费、会计师事务所的审计费等。整个登记过程，涉及登记管理、技术监督、合作经济组织挂靠单位等多个部门和单位，手续较为繁杂。
(三)居住分散地区的农民组织起来困难较大
由于地方财政支持力度小，借贷困难，相对于我国东部发达地区，两省农民合作经济组织的发展均处于较低的水平。受资源、资金、技术等因素的制约，两省的农民合作经济组织不仅数量少、规模小，而且功能单一、分散、辐射力不强，多数局限于生产和流通领域，技术推广型、农副产品加工型和综合服务型的合作经济组织较少。在生产经营活动中，这些合作经济组织与市场联系也不够紧密，抵御市场风险的能力不强，往往处于弱势地位。
(四)一些地方的干部和农民的契约意识、合作意识不强
主要表现是对农民合作经济组织的重要性认识还不够，导致组织内部运作不规范，没有章程或不能严格履行章程，有许多合作经济组织中途“夭折”。到目前为止，仍有一些农村干部只是埋头抓生产，不懂得“大流通带动大生产”的道理，这种重生产、轻流通的思想亟待转变。
三、对农民合作经济组织立法的几点建议
通过对云、贵两省农民合作经济组织的调研，当前在农民合作经济组织的立法工作中，建议着重研究以下几个问题：
(一)关于农民专业合作经济组织的性质和法律地位
当前，农民合作经济组织以企业、社团、中介组织等多种形式存在。鉴于此，农民合作经济组织不能完全等同于一般企业。在按照市场经济规律运作方面，农民合作经济组织与其他企业是一致的，但二者不同的是，在这种组织中农民是与市场对接的主体，既与企业相似，在市场中求生存，更重要的是带有中介组织的性质，根据我国目前农民合作经济组织的特点，在运作过程中又带有一定的市场行为。因此，通过立法明确农民合作经济组织的性质和法律地位，使其具有独立的法人资格参与市场竞争，是发展和规范农民合作经济组织的关键问题。如果这个问题能界定清楚，其他问题就较好解决。
(二)关于农民合作经济组织的注册登记
从云、贵两省乃至全国的实际情况来看，存在着大量农民合作经济组织不能及时正确地进行注册登记以及注册登记不规范、不统一、管理混乱和执法主体不明确等问题。目前我国农民合作经济组织正处于发展初期，法律应当立足于保护和推动其健康、有序地发展，在登记管理的环节应当尽量避免多头管理，要按照农民合作经济组织的性质确定其行政主管部门，同时还要简化注册登记手续，降低收费门槛。这个问题还应作进一步的调研。
(三)关于农民合作经济组织与政府的关系
农民合作经济组织是实现农民组织化的重要途径，为了使其健康、有序地发展，应当由政府加以引导和规范。按照政、事、企分开的原则，政府依法对农民合作经济组织进行扶持、引导、服务和规范，既不能包揽过度、干预过多，也不能撒手不管，更不能搞运动、急于求成、一哄而起。同时，还要注意不能干预合作经济组织的内部事务，防止将农民合作经济组织变成官办机构，要明确行政主管部门及其职权范围，围绕转变政府职能发展农民专业合作经济组织。

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