企业管理模型没有一个固定的模式，不同的企业、在不同的发展阶段可能需要选用不同的管理模式。对于管理信息系统建设来说，它并不是完全仿真企业现有的手工管理系统，而是要从一定的起点上构造一个反映一定的管理理念的、科学的管理信息系统。选择一个适合于本企业特点的管理模式是非常必要的，也是十分重要的。企业整体管理模式的合理性将决定信息系统建设的成败。因此在系统建设方面也必须考虑这个方面的问题。
正确选择企业的管理模型应该考虑如下几个方面的问题：
1、系统分析人员必须深入到企业的各个管理环节中调查研究
不经过这个过程，或者完全凭借一些基层的汇报材料就下结论，很容易作出错误的选择，因为很多问题和矛盾隐藏在组织的内部，基层管理者要么不愿意、要么是不敢、要么是缺乏能力等方面的原因，没有能够将这些问题和矛盾揭示出来；企业的中高层管理者由于各种考虑可能也不能或不愿顾及。只有深入调查，才能掌握合理选择管理模式所需要的第一手材料。
2、对现有的管理模式中不科学、不合理的部分要敢于否定
企业在从传统向现代转型的过程中，必然要触及到否定过去的管理方式。由于习惯势力的顽固性，以及对各部门的利益可能产生的影响，要推出一种新的管理思路所遇到的阻力是可想而知的。要使管理系统建设有一个高的起点并符合当代管理的发展潮流，必须克服一切阻力和困难，向传统观念发起挑战。在这个过程中，可能需要来自中上层领导和管理者的支持和协调，需要他们拿出魄力、顶住压力，亲自参与或辅助系统分析人员的工作，使问题的解决落到实处。LOCaLHOsT
3、管理模型的选择又要结合本企业的具体情况
对于不同的企业，如生产性、管理性或服务性企业，应该选用的管理模型会存在明显的区别，以中国三峡总公司的情况为例，该公司是一个业主单位，负责一个工期长达17年的一次性的三峡工程的建设管理，带有很明显的项目管理的特点，三峡工程管理的原则在中国三峡总公司成立时即已确定，即是业主负责制，招标投标制，工程监理制，合同管理制。这个情况是既定的，不能修改的，这就是所谓“本企业的具体情况” 。然而“四制”具体实现的方法以及实现的效率是要靠三峡总公司内部及其对三峡工程管理的具体模式来决定的，这就需要在上述“四制”的框架以内，依据有效进行项目组织的原则选择合适的管理模式，而不应该突破这个框架。
三峡工程管理系统在选择管理模型时，充分考虑了三峡工程建设管理所面临的各种内部和外部环境，坚决果断地抛弃了传统水电建设管理体制下的行政分割严重、责权利混乱不清的做法，实现了以项目为中心、一切围绕项目、一切服务于项目的全新项目管理模式，与此同时，也考虑了国内目前还无法摆脱的概算分割的做法，保留了一些必要的对口部门，如计划合同部，但这种部门也是围绕项目来开展工作的服务性部门，不能凌驾于项目管理之上。三峡总公司管理模型的主要特点可以概括为以下三个方面：
工程实行项目管理
在项目管理的原则下，实行分层授权责任制
建立以项目管理为中心的矩阵式服务体系