国家一系列支持“三农”的政策措施，大大改善了农民的生存权和发展权。但由于历史和现实的诸多原因，一些地方目前在土地征用、土地承包、农民工等方面仍然存在着侵害农民经济利益现象。据湖北省委政策研究室提供的情况，当前侵害农民经济权益主要有７种表现：
——土地征用中侵害农民权益。有的地方政府在征地补偿时低价征得农民土地，转手出让，获十几倍、几十倍利差。湖北省国土资源厅提供的材料表明，襄荆高速公路项目建设征地补偿标准偏低，各级指挥部门层层截留。《土地法实施细则》规定，征用土地的各项费用应当自征地补偿、安置方案批准之日起３个月内全额支付。湖北荆门市东宝区的该项目拨付征地补偿费的初始日期为２０００年８月２７日，但截至２００２年４月２３日，省指挥部拨付荆门市征地补偿费用应为８３６５万元，实拨７５２９万元，占９０％；市拨付到区的为６０２７万元，占７０％；区拨付到乡镇的为５８３７万元，占６９．７８％；而乡镇拨付到被征地村组的仅为４６４５万元，占５５．５％。荆州市纪南镇江店村反映，按法定最低标准计算，该村的安置补偿费标准应为４８００元／亩，而到达农民手上的安置补助费是５００元／亩，仅为法定标准的１０．４％。该村农民王典才一家８口人，被征用土地１２．３６亩，获得安置补助费仅６１６７元。征后仅剩土地１．８９亩，口粮都无法保证，全家举债养鸭维持生计。
——土地承包中侵害农民权益。一些乡镇政府和村委会依仗行政权力或者土地所有者代表的身份，控制土地流转，与农民争利。LOCaLhost有的剥夺承包农民的自主决策权，干涉农民在承包土地上自主安排经营项目，强迫农民购买指定生产资料或者按照指定的渠道销售农产品，对承包方合法流转土地承包经营权做出限制，截留、扣缴承包方土地流转收益等。２００２年底，荆州市太湖农场新风分场领导为搞“政绩工程”，强行毁掉与果农签定了１５年承包合同并已进入盛果期的２００多亩果园，统一建“万亩蔬菜基地”，造成果农经济损失每亩达１万多元，而农场单方面规定每亩只予赔偿５００元。有的地方违法收回农户承包地。江夏区庙山开发区乌树村村民反映，去年该村干部以建设“创业农庄”为名搞房地产开发，强行占地４０００亩，不愿意交地的农户，村里就通过黑势力，强行打人、平土地，村民上访如果被村里知道了，回去还要挨打。有的地方违法调整农户承包地，硬性规定几年重新调整一次，调整时随意提高承包费用，强迫农民流转土地承包经营权。汉川市南河乡业集村村民反映，去年村干部不顾村民反对，强行将１５００亩农田转包给武汉市一家纸业公司种树，造成大多数村民无地可种。
——拖欠民工工资侵害农民权益。全省去年底的“清欠”行动中，清查出拖欠工资２．５５亿元，涉及的民工人平１８００多元。湖北万利装饰公司拖欠１１个工程队民工工资，民工拿着欠条要求兑付时，公司法人代表陈刚将原件骗回撕毁。法院对其财产进行保全时，发现陈刚财产已经转移，有关部门无法为民工追回工资。民工吴柏清说：“孙志刚之死为司法建设作出了贡献，我非要把陈刚弄死不可，为民工讨工钱做贡献！”
——基层干部多吃多占侵害农民权益。据省经管局提供的统计资料，全省２００２年经过审计的３．８万个村中，有财经违纪的占１４％，其中贪污案件２３９６个，贪污总金额达３亿多元。团风县总路咀镇黄浦村是个无积累的穷村，但过去１２年间，村主职干部贪污挪用集体资产８万多元，招待费、送礼等开支４８万元，造成村级负债达７０多万元，村民人平７４９元。
——乱收费、乱罚款侵害农民利益。税费改革后，农村“三乱”问题虽然得到有效遏制，但在个别地方、个别领域仍有所表现，甚至还比较突出，侵害了农民的经济权益。
——假劣农资侵害农民权益。在农业生产领域，侵害农民权益最典型的要数假劣农资。特别是一些本应为农民服务的“官办”农业服务企业也参加售假，使农民不知道到哪儿能买到放心的农资。天门市麻洋镇五爱村棉农去年从市种子公司购的棉种，只开花不结果，造成经济损失近８０万元。
—— 告状难侵害农民权益。由于农民的合法权益容易受到各种社会强势集团的侵害，更希望得到国家公共权力的保护。但有些地方农民告状无门、告状难的问题十分突出。张世虎等１６名民工为讨要武汉市金伟流芳陵园公司拖欠的６．５万元工资，从找政府投诉到法律诉讼，耗时６年，花费１万多元，依然一无所获。