针对我国农村城镇化建设中面临的农业衰退风险问题，必须以科学发展观为指导建立城市现代产业对农业的改造机制。农业是城镇化可持续发展的基础产业，没有农业剩余，也就不可能有二、三产业的发展和城市素质的提高。这也就是说，农业现代化发展是城镇化发展的应有之义。因此，我国在二元结构进一步强化的条件下，要加快城镇化发展，就必须建立城市现代产业对农业改造的机制，加快农业现代化发展。
一是建立现代农业技术的研发机制。城市现代产业对农业改造的重点是提升农业技术含量，不断培育农业新品种，以品牌产品带动农业发展。这就要求大中专院校和科研院所在技术研究开发上，要在重视城市产业技术开发的同时，高度重视农业新技术的科研开发，实现城乡产业技术研究开发的有机统一。①政府要加大农业技术研究机构的支持力度。建立基础性农业科技开发的财政投入增长机制，实现基础性农业科技研究开发经费财政全额拨付机制，增加财政科研经费投入中农业科技研究经费投入的比例，重点支持生物工程技术、农作物品种改良与畜禽水产育种技术、重大农作物病虫害灾变预测和控制技术、农副产品加工贮运和保鲜技术、设施农业和工厂化农业技术、农业管理和信息技术等现代农业技术的研究开发，把重视农业高科技技术开发和发展与重视农业应用技术有机地结合，既站在国际农业先进技术的最前沿，大力发展生物技术、信息技术等高新农业技术，又重视应用基础研究开发，优先支持农业和农村经济发展中急需解决或有明显应用前景的基础性研究，加大实用性农作技术的创新力度，从而使得我国农业由传统农业向绿色农业、白色农业、蓝色农业、太空农业、基因农业、精准农业、设施农业、生态农业、都市农业和网上农业发展。loCaLhOsT②建立科学的农业科技评价体系。当前我国农业大学研究机构中的激励评价体系非结构化，专业利益驱动化，严重影响农业科技研究，排斥综合性、应用性研究与开发。为此，必须打破目前以论文及获奖作为农业科技人员晋升与发展主要指标的农业科技评价体系，建立一个有利于促进农业基础科学研究和应用研究相结合的长效机制。③鼓励农业大中专院校、科研院所的研究开发与县、乡农业技术推广机构相结合。在国家、省和地市级农业科研院所的改革中，除从事基础性科研的所、室外，应用性研究院所都要采取与县、乡农业技术推广机构相结合的措施，使科研人员深入实际，帮助农民解决生产中的实际问题，加大农业科研的针对性和先进适用技术的推广力度。
二是建立现代农业科技推广机制。农业科技推广机制是现代城市产业对农业改造机制的关键环节。因此，进一步改革农业科技推广体制是城乡现代产业改造农业的内在要求：①改革目前的乡镇级农技推广组织体系，在县级区域内建立跨乡镇的区域性中心农技推广站。区域中心站的建立将改变以往乡镇农技站小而全、力量单薄等弊端，有利于整合资源，提高农业技术推广水平，促进农业规模发展。②优化农技推广机构的服务职能。将农业其他专业与现有农技站职能合并至区域农技站，成为能够对农民进行综合服务的推广机构，由以前狭隘的农技推广变为广义的农技推广，并使之成为其他进行有偿农技服务团体（企业）的监督管理机构。③对区域农技中心站进行信息化建设。将区域中心站建成放大的窗口、扩展的平台、延伸的网络，把农技推广体系建设成为农业信息体系，将政府、科研单位、龙头企业、批发市场、中介组织、种养大户、农机大户、乡镇农村联结起来，提高信息的时效性、准确性、权威性。④加大农业技术市场建设。通过建立农业技术市场和网上农业技术产品交易市场，为农业科研机构、大专院校及民营科技企业的成果转化与市场化提供便利条件和保障，同时对发展民营农业科技服务组织与科技中介服务机构起到推动作用。
三是建立城市产业对农业改造的政策扶持机制。现代城市产业与农业融合是防范城镇化农业衰退风险的有效途径。现代城市产业与农业融合的内容主要包括现代城市技术对传统农业改造、现代城市企业直接参与农业生产经营。对于城市现代技术对传统农业改造问题，在前面已经分析，这里讲的城市产业对农业改造，主要是分析现代城市企业参与农业生产经营问题。要防范城镇化过程中的农业衰退风险，不仅仅是要用现代农业技术对传统农业技术进行改造，还应该促使城市企业参与农业生产经营，实现农业企业化生产和农业工业化产业链延伸，没有现代城市产业与农业的融合，只是局限于农业谈农业，在激烈的全球化市场竞争和产业结构升级中就会扩大农业的衰退风险。因此，政府必须建立城市现代产业对农业改造的政策扶持机制，对于直接投资于农业生产经营的企业要实行技术改造和固定资产投资的贴息贷款、3年内免征企业所得税等优惠措施；对于进行农产品加工的龙头企业不但在贷款贴息、税收减免、土地使用等方面进行优惠，而且政府可以成立龙头企业发展基金，根据企业与农户利益的关联程度和企业效益进行资金支持；同时，也鼓励农户按法定程序以土地承包经营权入股城市企业，与城市非农企业形成股份公司，结成紧密的利益共同体。这种城市产业与农业的融合，尤其是农户直接作为城市非农公司的股东，是实现农业生产经营现代化转型的有效方式，也是实现农民生产生活方式城市现代化的有效途径。通过城市现代产业与农业融合，增加了农业增值链，在增加农民收入的同时，也促使农民按照现代企业要求进行生产经营，有利于农民成为现代化职业农民。