期间，是我省畜牧兽医体制改革时期，其中兽医管理体制改革是我省畜牧兽医体制改革的主旋律。我省畜牧兽医机构和管理队伍在历次改革中不仅没有被削弱，而且不断得到加强。
各地积极推进畜牧兽医体制改革，通过内设机构的调整与整合，省、市、县三级建立了以畜牧兽医局为行政管理、以动物卫生监督所为执法监督、以动物疫病预防控制中心和畜牧技术推广站为技术支撑的新型畜牧兽医管理体制。到“十一五”末，全省已有１４个市（州）、７２个县（市、区）完成了畜牧兽医体制改革工作。
（３）投入额度前所未有，“四大转变”构成投入新机制。“十一五”期间，中央和省级财政对畜牧业的投入力度不断增加，投入范围不断扩大，投入方式更加多元。
在投入力度上，“十一五”期间，中央及省投入畜牧业基本建设、农业综合开发及财政专项资金３８亿元，比“十五”期间增长了近十倍，实现了从“九五”期间每年千万元级投入，到“十五”期间每年亿元级投入，再到“十一五”期间每年十亿元级投入的大手笔。
在投入范围上，“十一五”期间，中央及省投入涉及良种工程、动物防疫、标准化养殖、农业血防综合治理、草地保护和建设等方面，实现了从“九五”期间支持国有单位，到“十五”期间支持畜牧业生产发展，再到“十一五”期间支持现代畜牧业全面发展的大变迁。
在投入方式上，“十一五”期间，中央及省投入涉及基本建设、补助性投资、工作经费及补贴补助、贴息、担保、以奖代补等，实现了从“九五”期间财政拨款，到“十五”期间政策性投资，再到“十一五”期间直接投资、转移支付，保险、信贷、上市融资等金融手段全面扶持、公共财政全方位支持的大飞跃。
在投入渠道上，除了财政、金融、保险以外，在政策扶持和资金引导下，社会资本抢滩畜牧业，近几年投入规模养殖畜产品加工不下１００亿元，形成了社会资本投入主渠道，实现了投入渠道多元化。
回顾“十一五”全省畜牧业发展，可以说，省委、省政府高度重视畜牧业，全社会关心关注畜牧业，畜牧业在大农业中不可替代的作用得到强化，畜牧业的整体地位得到明显提升；畜牧业政策全面落实，畜牧业投入创历史新高，畜牧业综合生产能力显著提高；标准化规模养殖水平加快推进，畜牧生产专业化、设施化、自动化和信息化水平跨越式发展；重大动物疫病防控扎实有效，应急处置和快速反应能力不断提高；畜产品质量安全监管手段不断增强，监管体系日趋完善；畜牧兽医体制改革不断深化，畜牧发展活力显著增强。这五年，扶持政策惠及面最广、广大养殖场（户）受益最多、养殖热情最高，是畜牧业生产发展最快、变化最大的五年，全省畜牧业已经从传统产业开始步入现代畜牧业的发展轨

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