随着农村承包经营范围的不断扩大，极少数没有及时更新观念等存在的问题也日趋突出，制约了农村经济结构的正常调整，影响了农村经济的发展和农村的社会稳定。农村土地承包纠纷，主要是合同纠纷和侵权纠纷。如果处理不当，引发民事案件转为刑事案件也不是不可能，案例中已经有土地承包过程中因矛盾激化，而发生的故意砍毁他人经济农作物、故意伤害等案件的发生，虽然数量不多，但危害大、影响大，已经是影响农村社会稳定的重要因素之一。
造成这些纠纷的原因是多方面的：（１）有些乡镇政府行为不规范，对农民的自主经营权干预过多，越权处理承包合同的现象时有发生，对经济林、池塘水库等承包合同的干涉尤为突出，甚至违法行政侵害农民的土地利益。（２）有些乡镇政府工作不到位，缺乏必要的村社干部行政规范指导，造成农村承包合同的订立和履行中不必要失误，成为纠纷产生的重要因素，如有的村社干部漠视农民权益，往往巧立名目采取行政手段强制单方更改承包合同，有些农民土地、经济林、池塘水库等承包经营权尚未到期，就被强行收回或者另行发包，也不给原承包的农民合理补偿；有些村在发包土地时，违反民主议定原则，采用村委部分负责人“暗箱操作”的方式，根据个人好恶、亲疏远近擅自进行发包，引起群众不满；有些对外发包的土地承包手续不完备，未履行土地管理法所要求的程序，造成合同无效引发纠纷等。（３）有的乡镇政府缺乏市场调研，也未因地制宜，主观地用行政命令强迫农民进行模式经营，或者改变土地用途，打击了农民的生产积极性。（４）部分村社干部存在素质问题，在具体工作中难以正确地执行国家的法律和政策，甚至有违反法律政策发包土地现象出现，很容易引发纠纷。LoCaLHoSt（５）在履行过程中常常因为村委会负责人更换，新班子对前任村委订立的合同不满意，就否认原合同的效力，私自变更合同条款或对标的物重新发包，因为前几年订立的合同一般期限较长，承包费基数较低，随着人均收入的提高，有的发包人以合同承包费不合理为由，单方决定提高承包费，或者单方终止合同，另行发包，导致纠纷发生。（６）一些地方在本村妇女出嫁或者离婚后，该妇女并未取得新的土地承包权，原土地承包合同也未到期，即单方终止合同，收回其原来承包的土地，使该妇女因为出嫁或者离婚丧失了土地承包权。（７）农民承包方未按约履行合同造成纠纷，有的承包户以低价承包，又擅自以高价转包，从中坐收渔利；有的不遵守合同约定，故意拖欠承包费；有的承包户不主动交承包费，村委也不进行催收；有的村委班子更换，集体事务无人管理，造成承包户未能及时交纳承包费；有的承包户擅自改变土地用途，违反合同约定破坏土地和林业资源，损害集体的利益。
笔者认为，土地承包纠纷矛盾源于多个层面，须标本兼治，多管齐下：
（一）尽快建立完善县级农村土地仲裁工作机构，制定与农村土地承包法相配套的规章制度；
（二）乡镇政府要切实加强农村土地承包管理，规范农村土地承包行为；
（三）司法机关和乡镇政府要加强对农村基层调解组织的业务指导，强化基层调解，充分发挥基层调解组织在调解农村土地承包合同中的作用；
（四）强化农村法制宣传工作，提高农民的法律意识和法制观念，自觉守法、护法，自觉运用法律武器保护自身的合法权益，从而有效防止各种矛盾纠纷的发生。