企业企业会计核算体系中建立有关企业使用自然资源及对所造成的环境污染治理情况的会计核算，即从微观企业的角度测算环境、资源的影响。和宏观环境经济核算一样，通过对环境问题进行货币计量，从价值上对消耗与补偿进行平衡，对企业进行环境会计核算，是对企业在环境问题上履行社会责任的考核和评价的重要指标。由于微观环境经济核算是以企业作为核算主体，微观环境经济核算体系属于企业会计核算体系的一个分支，故在进行环境经济综合核算时必须考虑以政府为主体的宏观环境经济核算体系和以企业为主体的微观环境经济核算体系。
绿色会计是绿色国民经济核算和绿色gdp核算的基础，他能为后者提供充实的微观数据基础。在统计部门核算gdp的时候，由各个工业部门提供相关的报表及数据，但对于绿色国民经济核算和绿色gdp核算来说，企业不可能把“环境损失”、“资源损失”等数据进行上报，因为在目前的微观会计核算和微观统计核算中这些数据是难以统计的，这样也造成了绿色gdp核算相关数据搜集的困难。在国家统计局和环保总局全国十省市绿色gdp核算试点中，试点地区也一直试图通过对污染损失案例的调查，建立地区环境污染经济损失估算模型和估算方法，确定估算技术参数，但最终只能就某一地区的某一行业进行这样的估算，尚缺乏在全国范围内一致认可的绿色gdp核算相关参数。归根结底，是企业微观核算数据的缺失，而绿色会计的全面推行将为绿色国民经济和绿色gdp的核算提供详实的环境、资源耗损数据。因而，企业绿色会计核算可以作为绿色国民经济核算和绿色gdp核算的前提和基础工作。