当前，在农村村级组织建设工作中，一些村的“两委”班子工作关系不协调，特别是村党支部书记与村委会主任之间矛盾重重，难于正常开展工作。主要表现在：
１、村党支部书记搞个人说了算，独揽一切，“唱独角戏”， 使村委会的作用不能正常发挥，处于被动随从地位。本来是村委会职权范围内的事情，村党支部却要干预，剥夺了村委会和村民代表大会的权利。
２、村委会主任置党支部的领导于不顾，无视党的方针政策，一味强调村民自治和村民代表大会说了算，搞绝对化民主，使民主权利脱离了正确轨道。
３、村党支部书记和村委会主任之间闹不团结，互不通气，互不相让，讨论工作时经常吵架。一人一面鼓，一人一把号，各击各的点，各吹各的调。出现问题互相推卸责任，互相推诿。还有的村主任书记明合暗不合，各领一班人马，各行其事。以上现象虽然发生在少数村级组织中，但是，给党的农村工作却带来了极为严重的负面影响。导致党的方针政策不能顺利贯彻落实，党支部的战斗堡垒作用不能正常发挥，使村班子分裂涣散，增加耗散力，减少凝聚力、战斗力，严重影响致富进程。
问题产生的原因：
1、村党支部与村委会的职权范围不清
村党支部是党在农村的基层组织，是村级组织的领导核心。有的村干部和党员，尤其是村党支部书记，错误的认为，党支部是领导核心，就应该所有的事情都由党支部说了算，搞绝对集中，排斥村委会的对村民自治范畴内工作的领导和指导。
村民委员会是村民的自治组织。有的村民、村干部尤其是村委会主任，错误的认为，村民自治，就是“村民自己的事情由村民自己说了算”，而自己是村民选 出来的村官，自然村里的事情就应该村委会说了算，并自认为，这样做合理合法。LocaLhOST村党支部是党员选举产生的，管好党员和党支部建设就行了，从而排斥党的正确领导。思想认识的混乱，必然导致行为的不正确。
2、村级领导班子成员的素质不高
客观的讲，目前，村级干部的文化水平、*觉悟、工作能力还不是十分太高，在民主选举过程中有些人靠拉票，搞宗派等手段“上台”，“上台”的目的不是为群众着想，或者说不是为了大多数群众着想。有的村干部“上台”后，工作方法简单粗暴独断专行；有的铁哥们帮派意识；有的不善于学习，不知“自己是干什么的”问他村委会主任应该做什么，他都说不清，社会经验、创新意识很缺乏，只知道当“官”，做老爷，光宗耀祖。还有部分村级领导能力太低，开会不能讲话，原则政策不了解，方法没有。由于素质低，尤其*素质太低，政策水平差所以产生的争权夺利等问题。
3、对村级干部的考核管理、培训措施不尽完善。
目前，对村级领导班子的年终考核多以完成情况而论。只要各项工作任务完成的好，税收、统筹上交及时，农建、计生任务完成了，就算好干部，以此来定工资和奖励。不去考核其在完成任务过程中是怎样做的，另外考核项目赋分权重也未尽合理。
党支部这层组织，党委尚有权过问，村委会主任是民主选举产生，党委不能对其直接行使撤换、改选的权利，须经村民代表大会或全体村民大会才有权罢免，这就使部分村委会干部对党的领导观念淡薄。老百姓若非忍无可忍，是不能罢免其自己选出来的领导人的。导致部分村干部一任三年缺乏制约。
那么，怎样才能处理好村级两委的关系？这就要求村级两委要做到：
一、明确职责，准确定位，各司其职
在我国现今农村的基层组织中，最主要的就是村党支部和村民委员会，而处于领导地位的是党的基层村党支部，村委会是村民的自治组织，那么村党支部和村委会是什么关系呢？这要从这两个组织所处的地位和作用谈起：
（一）、村党支部
1、村党支部的地位和作用
⑴、村党支部是党在农村的最基层组织
中国*党的组织是由党的中央组织、地方组织和基层组织构成的。党的基层组织包括党委、总支部和支部。党支部处在最基层，是党的组织基础。
党支部是把党员组织起来的必不可少的一种组织形式。党支部这一基层组织，每一个党员都组织起来，并服从上级党组织的领导，才能把全国分散的党员集合起来，形成一个具有统一意志、统一行动、统一纪律的整体，团结一致地去完成党所承担的历史任务。
⑵、党支部是党联系群众的桥梁和纽带
不论是过去战争年代，还是在社会主义革命和建设时期，党的任何一项任务，如果没有亿万人民的支持、拥护和积极参加，就不可能得到成功，人民需要党，党离不开群众。与人民群众取得最广泛的联系，直接关系到党和国家的盛衰兴亡。因为党支部和党的领导机关相比，总是处在与人民最接近的地位，因此，在党与人民群众之间，党支部所处的地位是十分重要的，起着桥梁和纽带的作用。一方面，党的路线、方针和政策，要通过党支部日常的工作，具体地贯彻到人民群众中去，使人民群众团结在党的周围，为实现共同的目标和利益而奋斗。另一方面，群众的意见、情绪、要求和愿望，也要通过党支部反映到各级领导机关，使党的各级领导能够及时地了解群众的思想动向，避免工作的失误。
⑶、党支部是党在社会基层的战斗堡垒
党支部是按照生产和工作单位建立起来的，处在各行各业的第一线，是使党的路线、方针和政策在各个社会基层单位得以落实的重要保证。因此，党章规定“党的基层组织是党在社会基层组织中的战斗堡垒”。党支部的战斗堡垒作用主要体现在是个方面：
①发挥*核心作用，保证党的路线、方针和政策在基层贯彻落实。党的领导，首先是*上的领导，即通过贯彻正确的*路线和方针、政策来实现。党支部作为党的基层组织，其根本任务就是坚定不移地贯彻执行党的路线、方针、政策，国家的法律、法令，要宣传和坚持四项基本原则，保证基层单位坚定正确的*方向；
②支持行政首长依法行使职权，保证本单位所承担的生产、工作任务的完成。党支部要有效地支持行政首长充分行使职权，帮助解决生产、工作中所遇到的难题；要围绕中心工作开展群众工作，提高党员和群众生产、工作的积极性，与行政首长一道，努力完成本单位的生产、工作任务；
③充分发挥党员的先锋模范作
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