原发性肝癌组织双向电泳技术优化 |
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2.1 蛋白沉淀方法对电泳结果的影响
从图1可见,未经处理的样本蛋白点虽然很多(1 920点),但分辨率很差。丙酮,TCA-丙酮,Cleaning-up 试剂盒沉淀后的样本与原始样本相比均有很多改善,但TCA-丙酮丢失的蛋白较多(1 644点),丙酮(1 856点),和Cleaning-up(1 713点)丢失的蛋白较少。图 1B中,经TCA-丙酮沉淀后,酸性蛋白大量丢失。图1C中,丙酮沉淀蛋白点数多且清楚,无明显拖带和条纹,背景干净清晰,说明蛋白质富集和纯化的效果都比较好。 2.2 不同聚焦条件对电泳结果的影响
图2中,A聚焦电压是80 kV,B聚焦电压140 kV。由于聚焦时电流较高,将500 V延长2 h,1 kV延长了1 h,从图中可见B的聚焦效果比A有很大改善。图C是我们监测的延长低压聚焦后(图B)的IEF电压走势图,从图中可见电压升至设定的80 kV进行聚焦。图2 B蛋白点数较A明显增多,特别是酸性端,说明B聚焦效果明显好于A。
2.3 主动水化与被动水化上样的电泳结果
从图3中可看出,图A中的蛋白点数明显增多,点也更圆 ,而且没有图B中的横条纹。说明主动水化比被动水化的聚焦效果更好。
3 讨 论
双向凝胶电泳(2-DE)由于其在展示全部蛋白质表达改变并鉴定特异性蛋白方面的优势,成为目前蛋白质组学研究首选的分离技术[4],近年来得到了较大的发展与改善,但实验结果的重复性和稳定性仍有待提高[5]。我国关于肝癌的蛋白质组学研究越来越多,由于肝癌组织成分复杂,干扰成分多,个体差异大使其双向电泳实验条件难以严格控制[6],目前尚没有针对该组织的双向电泳技术的方法学的系统报道,为此,我们对肝癌组织蛋白的制备、一向聚焦程序、上样方法等关键步骤进行研究对比,优化总结出一套可行的,重复性好的双向电泳方法,供大家参考。
3.1 样品制备
蛋白质样品的制备是的关键环节,关系到蛋白质组研究结果的准确性[7]。样本制备主要包括蛋白提取与沉淀两个步骤。蛋白提取过程需尽可能地溶解和解聚蛋白质[8]。通常采用分级提取蛋白的方法,但是繁琐的样品制备步骤容易造成 上一页 [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] 下一页 |
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