务人员应该参与到资金管理的全过程，对于整个过程进行统筹规划，根据“资金流到哪，管理管到哪”的思想，尤其是要加强对资金支出方面的管理，保证资金使用的高效率。如让财务人员能及时了解项目进度，据此有效的进行付款安排，当然这需要整个单位提高对财务工作的重视程度以及业务经办人员的积极配合。
(3)细化预算编制，拓宽专项资金管理方法。
增强预算本身的透明度，就是要细化预算，使预算支出落实到每一个项目和每项支出的每一款。资金使用单位在专项开展之前应制定尽量详尽的费用预算，在项目开展过程中应尽严格按照预算标准执行，资金支出过程中应加强业务人员与财务人员的沟通，使财务人员及时了解项目进度，及时安排项目资金，财政部门也应奉公执法，不能无故滞留专项资金，以保证项目的顺利进行。在项目完成后业务经办人员及时进行项目报销工作，并进行专项资金的使用情况分析，形成专门项目决算，阐明形成预算和决算差异的原因，便于准确向财政部门汇报专项资金使用情况。最后将专项资金项目结余资金返还财政。不能私自挪作他用。
(4)实施专项资金绩效评价，促进专项资金规范核算。
专项资金绩效评价是指考核部门公共服务的成本耗费和效率水平，根据不同项目支出结果，比较项目之间的社会成本效益，在可能的情况下比较不同支出组合所产生的社会价值，以及单一项目实现效益情况。专项资金绩效评价有赖于专项资金核算提供的会计信息，而实施绩效评价又能促进专项资金进行规范核算。进行综合评价，可以规范资金使用范围和标准，判断资金使用效率。实施专项资金绩效评价可以在事前，也可以在事中或事后。事前评价，有利于预算编制的科学、合理性；事中评价，可以分析研究项目进展情况，及时处理工作中出现的问题；事后评价，则可以审查和评价对项目支出成果是否符合目标要求。通过建立财政专项资金效绩评价分析制度，对提高预算编制科学性和合理性，优化资金结构，规范会计核算，强化监督管理都将起到积极的作用。

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