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EMB基因330密码子分子DNA探针设计及荧光检测 |
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EMB基因330密码子分子DNA探针设计及荧光检测 |
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近年来,国内外学者在分子水平上对引起结核乙胺丁醇(Ethambutol,EMB)耐药的突变基因作了详尽的研究。研究结果表明结核杆菌embB基因306位密码子突变是耐EMB产生的主要原因,其他285、303、330密码子等突变也是引起该类耐药的重要原因[1]。针对广泛存在的单碱基突变位点不易检测,应用分子探针高灵敏直接检测单碱基突变是近年来一个重要技术发展。其中具有茎环结构分子DNA探针就是一类根据核酸碱基配对原则和荧光共振能量转移(FRET)现象而设计的DNA探针,对单碱基检测具有很高的灵敏性和特异性[2]。本研究选择结核杆菌耐乙胺丁醇一个重要突变位点embB330密码子,设计相应的分子DNA探针,通过扩增及杂交、采用荧光分光光度计观测液相杂交荧光信号,并比较测序结果,为结核杆菌耐药位点准确测定提供一种新手段。
1 材料与方法
1.1 乙胺丁醇耐药菌株、标准株来源及其基因组DNA提取
结核分枝杆菌标准株H37RV(ATCC 27294)来源于中国药品生物制品鉴定所,耐乙胺丁醇结核分枝杆菌菌株来源于重庆市肺科医院(42RE\A021E\307E等共33株),金葡菌对照组来源于本科室。按全国结核病细菌学检验标准化规程进行分支杆菌培养(Roch培养基)、菌种鉴定和药敏试验。灭活条件为:85 ℃,1 h。采用QIANGEN公司的细菌基因组DNA提取试剂盒提取DNA,耐乙胺丁醇结核分枝杆菌菌株和标准株DNA提取后,置-20 ℃冰箱中备用。
1.2 主要仪器
荧光分光光度计、热循环仪(GeneAmp PCR System 2700型)、碧云天恒温水平摇床、电泳仪、离心机等。
1.3 引物及分子DNA探针设计、合成
经查寻文献,选择结核杆菌耐乙胺丁醇 上一页 [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] 下一页 |
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