ecfa后续协商的一项重要内容，也是台湾方面最为关注的重大经济议题。尽管两岸为签署该协议作出了巨大努力，但由于双方在投资保障关注重点与投资争端解决机制等方面存在分歧，导致去年未能完成该协议的签署。如何在重视台商保障权益的基础上，形成互利共识及排除障碍，致力于提高投资规定的透明度，逐步减少双方投资限制，促进投资便利化应是双方共同努力的重要方向之一。若能将国际规则与两岸特色有机结合，两岸投资保障解决机制可望在年内顺利签署。
争端解决机制是ecfa框架下处理两岸经贸争端，落实与实施ecfa相关内容的重要机制，涉及许多国际规则与技术性问题，两岸在这一问题上仍存在不少分歧。以两岸对于双方在wto体系中的内部关系存在的立场为例，大陆认为，在两岸同属一中、ecfa本身就带有鲜明两岸特色的框架下，双方经贸关系产生的争端，并不必然要诉诸wto争端解决机构。台湾方面则出于岛内政治需要另有考量。这一分歧不仅凸显两岸关系的复杂，也产生了在ecfa框架下如何适用wto规则的问题。两岸唯有通过细致的协商，在对“wto规则的适用范围”作出明确约定的基础上，充分考虑两岸关系的特殊性，才是解决两岸经贸争端及签署相关协议的良策。
总体而言，较之于框架协议，单项协议涉及范围更广，内容也更具体，商谈难度障碍更大，有待双方继续秉持“平等协商、互利双赢、彼此照顾对方关切”的原则，按照“先易后难”的步骤，以更大的智慧、更开阔的胸襟、更务实的态度共同推进后续谈判，签署相关协议，以达成互利共赢的目标。
五、岛内政治因素的干扰令人担忧
相比较而言，两岸无论在“早期收获计划”的落实，还是在ecfa后续协商及协议执行等方面，台湾方面需要面对解决的问题都更多。随着年底“立委”选举与逐渐展开的台湾地区领导人选举的不断加温，岛内政争对ecfa未来走向将产生不可低估的影响。
两岸商签ecfa的过程中，民进党等“台独”势力曾强力抵制和反对，甚至誓言将发起“十年抗争”。但当协议公布后，岛内外一片肯定之声，台湾多数民众认为ecfa对促进岛内经济发展和改善民生有利，迫使民进党鸣金收兵，退出“战场”，在五市选举中刻意回避这一议题。民进党主席蔡英文为打消民众对民进党上台会废除ecfa的担忧，还公开称该党如胜选执政将“延续前朝政策”。但是，该党从一味地非理性反对转向以“谁得利，谁受损”议题操弄民粹，在选举气氛下，必然会给即将就要“见真章”的后续协商增加很大的难度。
在ecfa商签阶段，大陆从两岸关系和平发展的大局出发，充分考虑到岛内经济受国际金融危机冲击较大及岛内各种复杂因素，超越技术层面的障碍，促使两岸直接进入对台湾有利的类似自由贸易谈判，先签署框架性质的协议，并在不要求台湾方面取消对大陆产品和投资歧视性措施等属于“正常化”内容的情况下，以绝对“让利”的姿态，促成早收清单协议，以使台湾相关产业尽早收益。但是，两岸终归都是wto成员，仍需遵守一些基本规范，双方在后续贸易协商中，依规定必须订出“自由化”时间表。未来，台湾要补的“功课”还有不少，例如，需要逐步调整对大陆产品进口管制，给予零关税；服务贸易及投资市场开放，也必须有类似安排。这或许要经过一个较长的过程，但两岸经贸必须同时超越“正常化”和“自由化”两大关卡，两岸协商也将从大陆单方面“让利”进入双方“换利”阶段，这已无可回避。
更重要的是，ecfa未来前景将在很大程度上受制于岛内政局变化及两岸关系整体形势。假如未来岛内发生政党轮替，新当局不愿接受两会协商的重要前提——反对“台独”、坚持“九二共识”，即使其宣布延续原有政策，ecfa也会变调甚至名存实亡。海协会会长陈云林近期有关“如果有一天反对‘台独’没了，‘九二共识’也没了，可能一切都要重新考虑”的谈话，虽未点ecfa，但显然有很强的针对性。这一重要信息值得外界高度关注

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