证据知识库的架构
3.1知识架构
循证医学是运用流行病学的科学方法沦解决医学各种问题而发生的一场医学实践的革命。循证医学则认为:经验远不如科学研究的知识快速和可靠,从科研中学习是第一位的,经验仅可以弥补科研知识的不足。循证医学依赖于计算机、网络通讯、互联网等技术,而循证医学临床证据知识库则是其核心。关键是临床研究证据质量及其知识体系。
循证学知识库的知识体系可分为3个层面:
第一层面:循证学知识的丰要方面(一级架构)包括:“基础”知识、循方法、实用知识、支持体系和其他知识。
第二层面:循证医学荩本知识的架构(循证方法、二级架构)包含循证实践操作流程和各步骤的展开。构成循证隈学的基本知识和核心知识——循证方法。
第三层面:循证医学实用知识的架构(三级架构)是循证流程与病症的描述和处理流程的融合。包括病症表现的循证、流行情况的循证、病因的循证、危险囚素的循证、诊断的循证、治疗的循证、预防的循证和预后的循证等。
3.2内容的分类
为有利于对知识库使用者提供准确快捷的临床研究证据,知识席的证据可以根据不同需要分类:
3.2.1按研究方法分类。①原始研究证据(primaryresearchevidence);②二次研究证据(secondaryresearchevidence)。
3.2.2按研究问题分类。①病因临床研究证据;②诊断临床研究证据;③预防临眯研究证据;④治疗临床研究证据;⑤预后临球研究证据。
3.2.3按用户需要分类。①系统评价;②临床实践指南;③临床决策分析;④临证据于册;⑤卫生技术评估;⑥健康教育资料。
3.2.4按获取渠道分类:①公开发表的临床研究证据;②网上信息;③已完成,但未公开发表的临床研究证据;④在研的临研究信息。
3.3研究证据的来源
由于巾文循证医学证据知识库都是中文临床研究证据信息,因此知识库临床研究证据的来源也必然都是中文数据库、网络、杂志、会议文献以及在研和未发表的临床试验等。
目前,数据库资源中书目数据库有“中国生物医学文献数据库”、“巾国生物医学文献数据库”。临床研究证据专用数据库有中文循证医学图书馆(中文光盘版),由|fi围循证医学/(cochane)中心和当地软件公司共同开发制作。收录了系统评价数据库、临对照试验数据库、循证医学方法数据库、卫生技术评估数据库等循证医学一些相关知识与信息等数据库信息。网站有中国卫生部、中国疾病预防控制中心、中华医学会网站、中国循证医学中心网站等网站。此外有《中国循证医学杂志》、《循证医学》等医学杂志,还可以从围家科技图书文献中心、中国医学学术会议论文数据库等获取会议文献信息。
4相关的技术问题
4.1研究证据的采集
研究证据的采集从两方而获取。一是由杂志、会议文献等纸质临床研究证据经过扫描、识别、标引、引人证据知识库,完成采集工作;二是直接从网络现有的数据库中检索出自己所需要的临床研究证据,经过工具软件转换后进行标引,引入证据知识库。
4.1.1杂志文集采集流程。①书页扫描,即利用扫描仪对所需文献进行扫描;②图像处理,是指倾斜校正、去噪、剪裁、粘贴、亮度对比度调整、除装订线、内容居中等处理,目的是为了提高ocr识别率及美观整齐度;然后把一篇文章经扫描处理后的书页合并起来,存为pdf或t1f文件,生成与印本文献对应的数字对象文件。
4.1.2网络数据库的采集流程。①手工采集:可以采用搜索引擎技术实现对网络中特色信息资源的采集。按照预先制定的检索词、检索策略,利用通用搜索引擎如lgoogle、yahoo、baidu等进行检索并不断调整检索策略,直到得出较为满意的检索结果,手动将所需信息进行下载、格式转换、标引、加入知识库。②自动采集:面对数量大、更新快的网络信息资源,手工采集、组织信息的方法显然不能胜任工作,通常的解决方法是利用计算机技术实现网络信息资源的自动采集与组织。自动采集软件对网页进行精确分析后,将信息的标题、来源、内容、发布时间等项目存入知识库。③具有访问权限的网络信息资源的采集:现有的数据库,特别是使用价值较高的数据库,大多提供网络服务方式,采用密码口令或ip地址控制的方法实现用户对这些数据库或其镜像站的访问。主要采用手工采集、转换格式和标引的方法。
4.2研究证据知识库的发布
4.2.1 intemet发布。www是一种建立在intemet上的全球性、多平台、分布式、多媒体的动态信息系统。同telnet、go~pher、ftp、wais等相似,它也是建立在internet上的一种网络服务。www是internet上发展最快、应用最广泛也最实用的超文本信息发布系统,它将复杂的网络操作通过超文本技术和简单的协议变成了简单的“点击”,用户不需要网络知识和约定便可以容易地访问任意地点的计算机资源。为了满足用户使用的交互性,需要通过专门的手段将数据库与www连接起来,这些手段主要有cgi技术、专用api技术、java/jdbc技术等。通过这些手段建立起数据库的www服务器,用户通过internet登录到服务器上,执行浏览、检索等操作。通过in ternet发布:一是用户不需要专门设备,只需要一台计算机、一根网线就可以使用数据;二是实时数据,服务器更新后,用户不用升级直接可以得到最新信息。
4.2.2光盘发布。由于技术的发展,无论是服务器还是个人计算机都带有光盘驱动器,可以对光盘进行读取,这使得用光盘作为媒介发行临床研究证据成为可能。一是存储量大,一张vcd光盘的容量为700mb,而dvd则达到4.7gb;二是成本低,无论是vcd还是dvd,每张盘片的价格均不高;三是保存时间长,便于携带。我们所选用的知识库建设平台里都有信息发布系统,我们可以通过知识库建设平台对所建
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